В конце 1982-го года QUEEN решили, что им нужно сделать перерыв и отдохнуть друг от друга. Фредди моментально приступил к записи сольного альбома в мюнхенской студии Musicland. Одной из первых композиций, записанных в этой студии, стала вещь "Love Kills" для фильма "Метрополис". А в апреле 1985-го года в продаже появился сам альбом, названный "Mr. Bad Guy". В записи диска участвовали клавишник Фред Мэндел (Fred Mandel), гитарист Пол Винсент (Paul Vincent), ударник Курт Кресс (Curt Cress) и басисты Штефан Висснет (Stephen Wissnet) и Джо Барт (Joe Burt).

В марте 1987-го года Фредди полетел в Барселону на встречу с Монсеррат Кабалье, а в конце мая в знаменитом Ку-Клабе на острове Ибица состоялся грандиозный фестиваль, где Фредди был почетным гостем и вместе с Монсеррат выступил на закрытии фестиваля. Они исполнили песню "Barcelona", которую Фредди посвятил родному городу Кабалье. 8 октября 1988-го года Фредди и Монсеррат выступили еще на одном грандиозном фестивале - La Nit, на этот раз в самой Барселоне. Долгожданный совместный альбом "Barcelona" вышел 10 октября. Записывать пластинку помогали басист Джон Дикон (John Deacon, QUEEN) и клавишник Майк Моран (Mike Moran, ex-GILLAN).

Это выступление стало последним появлением Фредди перед публикой. К тому времени он был уже тяжело болен СПИДом, но объявил о своей болезни только за день до смерти. 24 ноября 1991-го года Фредди умер у себя дома в Лондоне от бронхиальной пневмонии, развившейся на фоне СПИДа.

В начале 1992-го года вышел сборный альбом "The Freddie Mercury Album", в который вошли перемикшированные композиции с "Mr. Bad Guy" и редкие вещи с синглов, а 20 апреля 1992-го года на стадионе Уэмбли состоялся концерт памяти Фредди с участием многих рок-звезд. И наконец в 2001-м году в продаже появилась грандиозная коробка с восемью компакт-дисками и двумя DVD, куда вошло все сольное наследие певца (известное и неизвестное), видео-клипы и документальная история.